|
|
Automatická segmentace cévních systémů myších jater v tomografických datech
Smékalová, Veronika ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Metodika zobrazení měkkých tkání se v biologii a medicíně diskutuje již řadu let. Celou dobu se vyvíjí metody, jak dosáhnout věrohodného a přesného zobrazení požadované tkáně či struktury. Rentgenová výpočetní tomografie výrazně pomáhá k dosažení tohoto cíle, ale je nutné neustále inovovat a vylepšovat techniky barvení tkání pro kontrastní zobrazení pod rentgenovým zářením, a také metody zpracování takto pořízených dat. Tato práce se zabývá problematikou zobrazení měkké tkáně myších jater s využitím mikro CT, uvádí postup kontrastování tkáně s využitím syntetické pryskyřice Mikrofilu, a také zpracování pořízených dat metodou prahování a nárůstu regionů s cílem zobrazení měřeného vzorku ve 3D.
|
|
|
Segmentace měkkých tkání v obličejové části myších embryí v mikrotomografických datech
Janštová, Michaela ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá segmentací měkkých tkání v obličejové části myších embryí v programovém prostředí Matlab. Segmentace měkkých tkání u myších embryí nebyla doteď plně automatizovaná a každý konkrétní úkol vyžaduje specifické řešení. Vyřešení dílčích problémů zefektivní a zrychlí tvorbu 3D modelu a takto poskytnou cenná data vývojovým biologům. Je zde popsána problematika barvení vzorků a segmentačních technik. Na základě dostupné literatury byly otestovány metody otsu prahování, narůstání oblastí, k-means shlukování a segmentace pomocí atlasů. V závěru práce je provedeno jejich testování a statistické vyhodnocení na 3D mikrotomografických obrazových datech.
|
|
|
Influence of Geometrical Parameters on Rupture Risk of Abdominal Aortic Aneurysm
Zemánek, Miroslav ; Janíček, Přemysl (oponent) ; Tonar,, Zbyněk (oponent) ; Holeček, Miroslav (oponent) ; Burša, Jiří (vedoucí práce)
The main objective of this thesis is finite element and experimental modeling of stress-strain states of the soft tissues specially focused on rupture risk of abdominal aortic aneurysm (AAA). The first chapter (chap. 1) summarizes the present state of the mentioned problematic and the major information published in the present-day literature. The key factors for AAA rupture risk decision are also summarized in this chapter. The next chapter (chap. 2) describe the artery wall histology, type of aneurysms and mechanical behavior of artery wall. The second part of the thesis (chap. 3) is focused on experimental modeling of stress-strain states of soft tissues which is necessary for reliable finite element modeling of this behavior. In this chapter a specially designed and produced experimental testing rig is described and the type of tests which is possible to realize with this testing rig. The key factors influencing the stress-strain behavior of the aortic tissue are also summarized and experimentaly tested on porcine thoracic aortas. The new knowledge resulting from experimental testing are summarized at the end of this chapter. The intention of third part (chap. 4) is the mathematical description of the stress-strain behavior of soft tissues, description of frequently used constitutive models and the parameter identification for these constitutive models based on the realized tension tests. The last chapter (chap. 5) is devoted to finite element modeling of the stress-strain states of AAA behavior. First the key factors and assumptions for finite element models creation and evaluation are summarized as well as the material parameters of the constitutive models which are implemented in ANSYS software. Several simulations were realized using hypothetical AAA geometry where the impact of some geometrical parameters change was tested. The backward incremental method using for evaluation of unloading state was designed and tested at real AAA geometry reconstructed from CT scans. Hypertension as one of the key factor for AAA rupture risk was tested using unloaded geometry. The new knowledge and possibilities of finite element modeling are summarized at the end of this thesis. The proposals to next research work is also summarized.
|
|
| |
|
|
Optimalizace laserové ablace měkkých tkání
Bischofová, Hana ; Kuchyňka,, Michaela (oponent) ; Pořízka, Pavel (vedoucí práce)
Spektroskopie laserem buzeného plazmatu (LIBS) je analytická metoda, která je využívána v mnoha oborech a používá se i pro prvkovou analýzu měkkých tkání. Aby mělo naměřené spektrum vlnových délek co nejvyšší intenzitu, je potřeba provést optimalizaci laserové ablace měkkých tkání. V experimentální části této diplomové práce byly ablatovány myší ledviny, jejichž vzorky byly připraveny dvojím způsobem, a to zalitím do parafínu a přípravou kryo-řezů. K ablaci byly použity femto- a nano-sekundové lasery s různými vlnovými délkami, energiemi a počty pulzů.
|
|
|
Efekt elektrické stimulace na hojení měkkých tkání
Fošumpaur, Karel ; Jeníček, Jakub (vedoucí práce) ; Angerová, Yvona (oponent)
Jméno, příjmení: Karel Fošumpaur Vedoucí práce: Mgr. Jakub Jeníček, Ph.D. Oponent práce: Název práce: Efekt elektrické stimulace na hojení měkkých tkání Abstrakt bakalářské práce: Tato bakalářská práce shrnuje současnou úroveň poznání ohledně efektivity elektrické stimulace na hojení měkkých tkání prostřednictvím zpracování přehledu problematiky. Cílem práce je popsat současnou úroveň výzkumu dané problematiky z hlediska jeho úplnosti, aktuální fáze a limitací. Systematickou rešerší bylo dosaženo patnácti odborných, relevantních článků, které byly do práce zařazeny a analyzovány. Pomocí analytického rozboru a zhodnocení studií je určeno zda a za jakých podmínek je elektrická stimulace pro hojení měkkých tkání efektivní. Mezi prezentované články patří studie testující efektivitu elektrické stimulace pro hojení strukturálně poškozené svaloviny, šlach, kůže a vaziva. Práce přináší převážně pozitivní závěr ohledně hojivého efektu elektrické stimulace. Klíčová slova: elektrická stimulace, hojení, měkké tkáně, sval, šlacha, kůže, vazivo, vaz, regenerace, reparace, elektroterapie
|
|
|
Segmentace měkkých tkání v obličejové části myších embryí v mikrotomografických datech
Janštová, Michaela ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá segmentací měkkých tkání v obličejové části myších embryí v programovém prostředí Matlab. Segmentace měkkých tkání u myších embryí nebyla doteď plně automatizovaná a každý konkrétní úkol vyžaduje specifické řešení. Vyřešení dílčích problémů zefektivní a zrychlí tvorbu 3D modelu a takto poskytnou cenná data vývojovým biologům. Je zde popsána problematika barvení vzorků a segmentačních technik. Na základě dostupné literatury byly otestovány metody otsu prahování, narůstání oblastí, k-means shlukování a segmentace pomocí atlasů. V závěru práce je provedeno jejich testování a statistické vyhodnocení na 3D mikrotomografických obrazových datech.
|
|
|
Automatická segmentace cévních systémů myších jater v tomografických datech
Smékalová, Veronika ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Metodika zobrazení měkkých tkání se v biologii a medicíně diskutuje již řadu let. Celou dobu se vyvíjí metody, jak dosáhnout věrohodného a přesného zobrazení požadované tkáně či struktury. Rentgenová výpočetní tomografie výrazně pomáhá k dosažení tohoto cíle, ale je nutné neustále inovovat a vylepšovat techniky barvení tkání pro kontrastní zobrazení pod rentgenovým zářením, a také metody zpracování takto pořízených dat. Tato práce se zabývá problematikou zobrazení měkké tkáně myších jater s využitím mikro CT, uvádí postup kontrastování tkáně s využitím syntetické pryskyřice Mikrofilu, a také zpracování pořízených dat metodou prahování a nárůstu regionů s cílem zobrazení měřeného vzorku ve 3D.
|
|
|
Influence of Geometrical Parameters on Rupture Risk of Abdominal Aortic Aneurysm
Zemánek, Miroslav ; Janíček, Přemysl (oponent) ; Tonar,, Zbyněk (oponent) ; Holeček, Miroslav (oponent) ; Burša, Jiří (vedoucí práce)
The main objective of this thesis is finite element and experimental modeling of stress-strain states of the soft tissues specially focused on rupture risk of abdominal aortic aneurysm (AAA). The first chapter (chap. 1) summarizes the present state of the mentioned problematic and the major information published in the present-day literature. The key factors for AAA rupture risk decision are also summarized in this chapter. The next chapter (chap. 2) describe the artery wall histology, type of aneurysms and mechanical behavior of artery wall. The second part of the thesis (chap. 3) is focused on experimental modeling of stress-strain states of soft tissues which is necessary for reliable finite element modeling of this behavior. In this chapter a specially designed and produced experimental testing rig is described and the type of tests which is possible to realize with this testing rig. The key factors influencing the stress-strain behavior of the aortic tissue are also summarized and experimentaly tested on porcine thoracic aortas. The new knowledge resulting from experimental testing are summarized at the end of this chapter. The intention of third part (chap. 4) is the mathematical description of the stress-strain behavior of soft tissues, description of frequently used constitutive models and the parameter identification for these constitutive models based on the realized tension tests. The last chapter (chap. 5) is devoted to finite element modeling of the stress-strain states of AAA behavior. First the key factors and assumptions for finite element models creation and evaluation are summarized as well as the material parameters of the constitutive models which are implemented in ANSYS software. Several simulations were realized using hypothetical AAA geometry where the impact of some geometrical parameters change was tested. The backward incremental method using for evaluation of unloading state was designed and tested at real AAA geometry reconstructed from CT scans. Hypertension as one of the key factor for AAA rupture risk was tested using unloaded geometry. The new knowledge and possibilities of finite element modeling are summarized at the end of this thesis. The proposals to next research work is also summarized.
|
host ::
RSS.